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El software marcará todos los elementos a escanearse con el mismo color, lo que significa que por defecto el sofwtare pedirá escanearlos juntos. Haciendo click en un elemento, el diente cambiará de color creando otro grupo de escaneado. Hacer click en too los elemento que se deberán escanear en ese segundo grupo. Haciendo click otra vez en uno de los elementos al que ya se ha cambiado de grupo, se creará un tercer grupo de escaneado marcado en un tercer color. Esta operación puede repetirse cuantas veces necesarias, acuerdese de que todos los elementos marcados en el mismo color se escanearán juntos.
El software no puede saber a qué posición corresponde cada elemento, por lo tanto pedirá al usuario identificar cada marker. El procedimento de identificación se explicarña en la página Herramientas de edición.