Ao clicar em um dos itens alinhados, o painel de alinhamento manual se abre para permitir ao usuário corrigir o alinhamento realizado automaticamente.
{{Screenshot|alinh_interfacealing_interface.png}}
Na etapa de alinhamento manual é mostrado, no centro da janela, o elemento fixo ou de referência ao qual o item detalhado será alinhado; no canto superior direito, o item flutuante ou em movimento que será combinado com a referência; uma barra de ferramentas específica.